Projets en cours
Nous travaillons en équipes de 2 à 4 étudiants, sur des projets différents, mais nous sommes tous liés par les outils que nous utilisons et nous nous rencontrons chaque semaine pour parler des avancées de nos projets et nous entraider sur les questions que nous pouvons enconter.
Ingénierie des phosphosites
Ce projet combine la biologie moléculaire et l'intelligence artificielle pour étudier les changements de conformation des phosphosites lors de la phosphorylation, en analysant plus de 20 000 phosphosites à l'aide de scripts Python personnalisés et en affinant les sélections à l'aide de prédictions Alphafold. La phase suivante consiste à valider une centaine de phosphosites sélectionnés à l'aide de la spectroscopie RMN pour confirmer les prédictions du modèle d'IA, ce qui pourrait faire progresser notre compréhension de la fonctionnalité des protéines et déboucher sur des applications révolutionnaires dans le domaine pharmaceutique et les études biomoléculaires.
Mini-kinases
Nous essayons de modifier les protéines kinases en supprimant certains de leurs domaines, mais de manière à ce qu'elles conservent leur fonctionnalité habituelle dans les cellules. Une fois que nous aurons obtenu ces domaines, nous aimerions les fusionner à d'autres protéines ou domaines protéiques afin de mieux réguler l'activité de la protéine (par exemple, l'ajout d'un domaine d'activation de la lumière pour que la lumière agisse comme un interrupteur marche/arrêt).
Mutants hydrophobes de protéines
L'objectif était de trouver des mutants hydrophobes de protéines tout en conservant la forme par des mutations aléatoires. Les acides aminés hydrophiles de la surface ont été remplacés par des acides aminés hydrophobes.
Conception et test de liants pour le récepteur EphA2
L'objectif est de concevoir et de tester des liants pour les récepteurs EphA2, qui sont des récepteurs surexprimés dans les cellules tumorales.
Introduction d'une voie alternative de fermentation alcoolique chez la levure
Nous sommes quatre étudiants en ingénierie des sciences de la vie travaillant sur l'optimisation de la production d'éthanol par la fermentation anaérobie des levures. Notre objectif est d'établir une voie de fermentation alternative dans les levures en étudiant l'intégration d'une voie de fermentation bactérienne présentant des avantages tels que l'atténuation du stress redox anaérobie ou le contournement des intermédiaires toxiques. L'efficacité des enzymes impliquées sera ensuite optimisée à l'aide de nouveaux outils d'IA tels que la RFdiffusion.
Liant du prion Ure2p
Nous voulons créer un liant protéique qui se lie au prion Ure2p dans S. cerevisiae, avec l'objectif futur de pouvoir concevoir un liant pour les prions causant des maladies chez l'homme.
Liant du prion Ure2p
Nous voulons créer un liant protéique qui se lie au prion Ure2p dans S. cerevisiae, avec l'objectif futur de pouvoir concevoir un liant pour les prions causant des maladies chez l'homme.
Liant du prion Ure2p
Nous voulons créer un liant protéique qui se lie au prion Ure2p dans S. cerevisiae, avec l'objectif futur de pouvoir concevoir un liant pour les prions causant des maladies chez l'homme.